冷凍研磨儀對樣品研磨處理的應用較為廣泛，其可對納米材料的制備、少量動植物樣品的細胞壁破壁、固相球磨反應、中藥研磨、植物種子和根莖葉無污染研磨等等操作。其可對樣品造成高效的混合應用，對樣品研磨的重復性好，同時可大批量的研磨樣品，且研磨時間短。

冷凍研磨儀對溫升的控制原理可分別分為風冷溫度控制、預冷凍溫度控制和水冷溫度控制三種，因此又稱為低溫研磨機。其組織研磨設備主要是在傳統實驗室球磨機的基礎上增加溫度控制處理的樣品研磨預處理儀器，使其低溫冷凍研磨法能夠實現樣品在低溫環境或室內恒溫條件下的細磨和其低溫研磨，使其冷凍組織研磨儀在對熱敏性、熱塑性延展性、纖維性、含糖性等難研磨樣品前可正常操作對試樣的前處理實驗分析。

在研磨設備的運轉過程中，磨球在球磨罐內的高頻率沖擊與摩擦，可產生大量的熱量，使磨罐內的溫度升高，但溫升的出現會使試樣的成分發生變化，其磨研時間越長，熱量越多；為避免樣品在研磨過程中出現性質的變化，因此需要其研磨環境的溫度進行控制，避免溫升的出現。

避免溫升出現的方法操作，無法是將其試樣及離心管適配器在液氮中進行液氮，快速研磨試樣，減少樣品研磨時間；或者應用冷凍研磨設備，使其研磨環境始終處于低溫環境，就杜絕了在使用過程中有可能出現的升溫現象。